Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tspan1Q99J59 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms