Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc8b1Q925Q3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc8b1Q925Q3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms