Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cldn16Q925N4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Cldn16Q925N4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn16Q925N4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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