Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Atg13Q91YI1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atg13Q91YI1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atg13Q91YI1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms