Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Atl3Q91YH5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atl3Q91YH5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms