Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Creb3l3Q91XE9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Creb3l3Q91XE9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms