Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx15Q91WE1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms