Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Csde1Q91W50 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Csde1Q91W50 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms