Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klc3Q91W40 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms