Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Sh3bgrl3Q91VW3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms