Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nsmce2Q91VT1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms