Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms