Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rhbdd2Q8VEK2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms