Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Slc6a20aQ8VDB9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Slc6a20aQ8VDB9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a20aQ8VDB9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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