Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nae1Q8VBW6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms