Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trpv3Q8K424 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpv3Q8K424 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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