Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Vrk3Q8K3G5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Vrk3Q8K3G5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Vrk3Q8K3G5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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