Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prpf39Q8K2Z2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms