Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Mrpl47Q8K2Y7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mrpl47Q8K2Y7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mrpl47Q8K2Y7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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