Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Scara5Q8K299 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scara5Q8K299 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms