Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Abcf3Q8K268 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Abcf3Q8K268 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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