Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prkd3Q8K1Y2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Prkd3Q8K1Y2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms