Protein–RNA interactions for Protein: Q8K021

Scamp1, Secretory carrier-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp1Q8K021 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scamp1Q8K021 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms