Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trip10Q8CJ53 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms