Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cog3Q8CI04 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cog3Q8CI04 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms