Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mterf1aQ8CHZ9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mterf1aQ8CHZ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms