Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Csnka2ipQ8CH19 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Csnka2ipQ8CH19 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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