Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Upp2Q8CGR7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms