Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx8Q8CFD4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms