Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp27Q8CEG8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Usp27Q8CEG8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Usp27Q8CEG8 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Usp27Q8CEG8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms