Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pramef8Q8CE24 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Pramef8Q8CE24 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pramef8Q8CE24 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms