Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc63Q8CDV6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc63Q8CDV6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms