Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM4

Ccdc73, Coiled-coil domain-containing protein 73, mousemouse

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc73Q8CDM4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc73Q8CDM4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms