Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lin52Q8CD94 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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