Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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