Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBG9

Rnf170, E3 ubiquitin-protein ligase RNF170, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf170Q8CBG9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf170Q8CBG9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rnf170Q8CBG9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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