Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ephb1Q8CBF3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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