Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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