Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Apoa5Q8C7G5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoa5Q8C7G5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms