Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc187Q8C5V8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc187Q8C5V8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms