Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sfrp1Q8C4U3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sfrp1Q8C4U3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms