Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ssuh2Q8C3L1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ssuh2Q8C3L1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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