Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp47Q8BY87 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Usp47Q8BY87 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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Usp47Q8BY87 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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Usp47Q8BY87 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp47Q8BY87 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Usp47Q8BY87 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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