Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trerf1Q8BXJ2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trerf1Q8BXJ2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trerf1Q8BXJ2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trerf1Q8BXJ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trerf1Q8BXJ2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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