Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cldn17Q8BXA6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Cldn17Q8BXA6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cldn17Q8BXA6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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