Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX22

Sall4, Sal-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall4Q8BX22 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sall4Q8BX22 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sall4Q8BX22 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms