Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Catsper4Q8BVN3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Catsper4Q8BVN3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms