Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms