Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BPC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Q8BPC6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BPC6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Q8BPC6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Q8BPC6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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