Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPB5

Efemp1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp1Q8BPB5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Efemp1Q8BPB5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Efemp1Q8BPB5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms